近年來，生物醫學工程碩士點承擔了國家自然科學基金,江蘇省自然科學基金，江蘇省高校自然科學基金等科研項目， 主要研究方向:

1. 人工心髒泵

人工心髒的特性分析與流場計算；

醫學電子儀器的設計；

永磁無刷電機的驅動控制。

2.神經肌肉工程

神經肌肉系統非線性動力學;

神經肌肉系統模式識别與運動控制;

局部肌肉疲勞與康複。